Еще в 1992 году Тверской областной совет народных депутатов принял постановление «Об утверждении и ведении Красной книги Тверской области». В том же году вышло решение «Об усилении охраны редких и находящихся под угрозой исчезновения животных и растений Тверской области», которым утверждался перечень видов животных и растений, занесенных в Красную книгу РСФСР, а также признанных редкими и находящимися под угрозой исчезновения, обитающих и произрастающих на территории области. В этот перечень было занесено 183 вида растений, лишайников и грибов и 160 видов животных.

В 2002 году вышла в свет первая Красная книга Тверской области, в нее вошло 217 видов высших растений, в том числе 56 мохообразных, 7 папоротниковидных, 5 плауновидных, 2 хвощевидных и 147 покрытосеменных; 34 вида лишайников, 18 видов грибов; 201 вид животных, в том числе 10 млекопитающих, 70 птиц, 7 земноводных и пресмыкающихся, 14 круглоротых и рыб, 100 беспозвоночных.

В настоящее время ведение Красной книги Тверской области осуществляет Министерство природных ресурсов и экологии Тверской области.

В целях обеспечения охраны редких и находящихся под угрозой исчезновения видов животных и растений, обитающих и произрастающих на территории Тверской области, приказом Министерства природных ресурсов и экологии от 10.10.2012 № 135-кв «Об утверждении Перечня (списка) объектов животного и растительного мира, занесенных в Красную книгу Тверской области» утвержден Перечень (список) объектов животного и растительного мира, занесенных в Красную книгу Тверской области (далее – Перечень). В Перечень включено 524 вида, из которых 204 - высшие растения, в том числе 65 мохообразных, 8 папоротниковидных, 3 плауновидных, 2 хвощевидных и 127 покрытосеменных; 47 видов лишайников; 22 вида грибов; 12 видов миксомицетов; 239 видов животных, в том числе 8 млекопитающих, 52 вида птиц, 7 земноводных и пресмыкающихся, 5 круглоротых и рыб, 167 беспозвоночных.

Для решения вопросов, связанных с ведением, периодическим изданием и научно-методическим обеспечением ведения Красной книги Тверской области, а также координации воздействия научных и общественных организации при Министерстве природных ресурсов и экологии Тверской области образована Комиссия по ведению Красной книги Тверской области.

Второе издание Красной книги Тверской области (дополненное и переработанное) вышло в свет в феврале 2016 года.